Xét nghiệm chẩn đoán đặc hiệu hơn [như nội soi đại tràng, nội soi ruột non, chụp barium] được chỉ định để chẩn đoán một số nguyên nhân gây chứng kém hấp thu.
X-quang tá tràng [ví dụ như chụp lưu thông, thụt đường ruột, Chụp CT ruột, chụp cộng hưởng từ ruột] có thể phát hiện ra các cấu trúc giải phẫu có khuynh hướng phát triển quá mức. Chúng bao gồm các túi mật tràng, rò, các đoạn ruột mù được tạo ra bằng phẫu thuật và nối thông, loét và các vết rạn da. Những nghiên cứu hình ảnh này cũng có thể phát hiện những bất thường về niêm mạc. X quang bụng thẳng có thể cho thấy vôi hóa tụy, cho thấy viêm tụy mãn tính. Chụp cản quang ruột non bằng Barit vừa không nhạy và không đặc hiệu nhưng có thể cho thấy những dấu hiệu gợi ý về bệnh niêm mạc [ví dụ như giãn các vòng ruột nhỏ, niêm mạc mỏng đi hoặc dày lên, sự phân mảnh thô của cột bari]. CT, cộng hường từ mật tụy và nội soi mật tụy ngược dòng có thể chẩn đoán viêm tụy mãn tính.
14Nghiệm pháp hơi thở C-xylose giúp chẩn đoán loạn khuẩn. 14C-xylic được cho uống, và thở ra 14CO2 nồng độ được đo. Giáng hóa của xylose bởi loạn khuẩn làm 14CO2 xuất hiện trong khí thở ra.
Nghiệm pháp hydro [H2] hơi thở đo lượng khí hydro được thở ra do sự phân hủy của cácbon hydrat của vi khuẩn. Ở những bệnh nhân có thiếu hụt disaccharidase, vi khuẩn đường ruột trong đại tràng phân hủy carbohydrate không hấp thụ, làm tăng hiđrô thở ra. Thử nghiệm thở bằng hơi lactose-hydro chỉ hữu ích để khẳng định thiếu lactase Không dung nạp carbohydrat và không được sử dụng làm xét nghiệm chẩn đoán ban đầu trong việc đánh giá sự hấp thu kém. 14 Test c-xylose và hydro đã thay thế các vi khuẩn của aspira trong quá trình nội soi để chẩn đoán hội chứng loạn khuẩn Hội chứng loạn khuẩn .
Xét nghiệm Schilling đánh giá tình trạng kém hấp thu vitamin B12. 4 giai đoạn của bệnh xác định xem sự thiếu hụt có phải là kết quả của thiếu máu ác tính, suy giảm ngoại ý tụy, tăng trưởng vi khuẩn, hoặc bệnh đường ruột.
Giai đoạn 1: Bệnh nhân được cho 1 mcg cyanocobalamin có chứa phóng xạ Po đồng thời với 1000 mcg IM không mang nhãn dán cobalamin để làm đậm màu các tế bào gan. Một mẫu nước tiểu 24-giờ được phân tích về phóng xạ; bài tiết qua nước tiểu